PHREEQC plus

Analýza A Revize Aplikací Pro Android: PHREEQC plus, Vyvinuté Společností J. Heyrovsky Institute Prague. Uvedeno V Kategorii Nástroje. Aktuální Verze Je 3.11.1, Aktualizována Na 13/02/2025 . Podle Recenzí Uživatelů Na Google Play: PHREEQC plus. Dosaženo Více Než 121 Instalací. PHREEQC plus Má V Současné Době Recenze 1, Průměrné Hodnocení 5.0 Hvězd

Popis a použití:
PHREEQC (autoři: David L. Parkhurst, C.A.J. Appelo) je oblíbený geochemický kód používaný pro speciační modelování. Naše aplikace přináší uživatelům zkušenosti s rozšířenými možnostmi díky integraci MOPAC (autor: James JP Stewart), CHEMSOL (autoři: Jan Florián, Arieh Warshel), XTB (autoři: C. Bannwarth, E. Caldeweyher, S. Ehlert, A. Hansen, P. Pracht, J. Seibert, S. Spicher, S. Grimme, P. Shushkov, M. Stahn, H. Neugebauer, J.-M. Mewes, V. Asgeirsson, C. Bauer, J. Koopman ) a DFTB+ (autoři: B. Hourahine, B. Aradi, V. Blum, F. Bonafé, A. Buccheri, C. Camacho, C. Cevallos, M. Y. Deshaye, T. Dumitrică, A. Dominguez, S. Ehlert, M Elstner, T. van der Heide, J. Hermann, S. Irle, J. J. Kranz, C. Köhler, T. Kowalczyk, T. Kubař, I. S. Lee, V. Lutsker, R. J. Maurer, S. K. Min, I. Mitchell, C. . Negre, T. A. Niehaus, A. M. N. Niklasson, A. J. Page, A. Pecchia, G. Penazzi, M. P. Persson, J. Řezáč, C. G. Sánchez, M. Sternberg, M. Stöhr, F. Stuckenberg, A. Tkatchenko, V. W.-z. Yu, T. Frauenheim) a další open-source kódy. Jakékoli vlastní druhy, které nejsou přítomny ve vestavěných databázích, lze vypočítat v rámci aplikace a výsledky použít v modelu (jinými slovy lze v každém běhu samostatně vytvořit novou, specifickou databázi). Kromě toho aktuální balíček obsahuje četné nekonvenční databáze využívající jak experimentální, tak i predikovaná/vypočítaná data z velkých databází, jako je CHNOSZ, ModelSEED, Alexandria library, KEGG a další doslovné zdroje.
Kromě rovnovážného stavu podporuje kód také kinetické modelování, pro které lze příslušné bloky klíčových slov generovat automaticky na základě předchozího výpočtu přechodného stavu. Jako alternativa pro nevodné systémy je k dispozici také speciační modelování FastChem Cond. Všechny funkce programu jsou dostupné offline.

Upozornění na přesnost výpočtu: MOPAC představuje rozumný kompromis mezi výkonem zařízení/časem výpočtu a přesností predikce pro širokou škálu typů sloučenin od malých až po středně velké molekuly. Přesnost je však omezená. Pro vyladění výsledných energií je integrován COSMO model od MOPAC i CHEMSOL solvatační modely, ačkoli CHEMSOL je původně zamýšlen pro použití ve spojení se strukturami a náboji počítanými na vyšších úrovních teorie. Proto je třeba se všemi vypočtenými rovnovážnými a rychlostními konstantami zacházet opatrně a považovat je za hrubý odhad v případech, kdy nejsou k dispozici žádná experimentální data (z zahrnutých databází).

DŮLEŽITÉ!!!
Přestože se tato aplikace skládá z otevřených zdrojových kódů a zdrojů, licence pro některé komponenty vyžadují, aby uživatelé při publikování výsledků citovali původní odkazy. Zkontrolujte prosím všechny licenční informace pod tlačítky „Licence“ a „O aplikaci“.
Všichni uživatelé aplikace PHREEQC PLUS dodržují tím, že ji stahují, instalují a používají, všechny licenční podmínky jednotlivých softwarových komponent a přebírají odpovědnost za jejich zachování.

Zdrojový kód aplikace: https://github.com/alanliska/PHREEQC-plus

Kontakt:
Kompilaci zdrojového kódu pro Android a vývoj aplikace pro Android provedli Alan Liška ([email protected]) a Veronika Růžičková ([email protected]), Institut J. Heyrovského Fyzikální chemie AV ČR, v.v.i., Dolejškova 3/2155, 182 23 Praha 8, Česká republika.
Webové stránky: http://www.jh-inst.cas.cz/~liska/MobileChemistry.htm

Seznam použitého softwaru třetích stran:
ACPDFVIEW, ANDROID SHELL, ARPACK, BLAS, CHEMSOL, CHIMESCALC, CPCM-X, CREST, DFTB+, DFTD4, EIGEN3, FASTCHEM Cond, GMP, GRAPHVIEW, LAPACK, LWONIOM, MBD, MCTC-LIB, MOPAC, MPACARGEstore, NUMSA OPENBABEL, OPENBLAS, OPENMOPAC, OPSIN, PHREEQC, PLOTMS, PYTHON, QCXMS, S-DFTD3, STDA, TBLITE, TEST-DRIVE, TOML-F, TRANSPOSE, X11-BASIC, XTB, XTB4STDA.

Více informací o licencích a referencích – viz licenční informace uvnitř aplikace.

Read more